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数据湖、云与共享平台:基因组数据分析与共享平台综述

基因组学 2018-12-27 v2 计算机与社会

摘要

数据共享平台将数据与云计算基础设施以及常用软件服务、工具和应用整合在一起,以创建用于大规模管理、分析、协调和共享生物医学数据的生物医学资源。在过去几年中,数据共享平台已被用于分析、协调和共享大规模基因组数据集。通过多个数据共享平台的互操作可以构建数据生态系统。在数据共享平台中策划、导入和分析数据可能相当耗费人力。数据湖提供了数据共享平台的替代方案,仅提供数据访问,而将数据的策划和分析推迟到后续阶段并委托给访问数据者。我们综述了用于管理、分析和共享基因组数据的软件平台,重点强调数据共享平台,同时也涵盖数据生态系统和数据湖。

关键词

引用

@article{arxiv.1809.01699,
  title  = {Data Lakes, Clouds and Commons: A Review of Platforms for Analyzing and Sharing Genomic Data},
  author = {Robert L. Grossman},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1809.01699},
  year   = {2018}
}

备注

28 pages, 4 figures