在高速公路上骑自行车：开源神经科学软件的危险状态
计算机与社会
2024-03-29 v1 其他定量生物学
摘要
大多数科学家需要软件来进行研究（Barker et al., 2020; Carver et al., 2022; Hettrick, 2014; Hettrick et al., 2014; Switters and Osimo, 2019），神经科学家也不例外。无论我们处理的是反应时间、电生理信号还是磁共振成像数据，我们都依赖软件来获取、分析和统计评估我们获得的原始数据——或者在我们进行模拟时生成此类数据。近年来，神经科学数据分析已转向依赖免费开源科学软件（FOSSS）（Poldrack et al., 2019），这与学术界更广泛的开放科学运动（McKiernan et al., 2016）以及更广泛的行业趋势（Eghbal, 2016）相一致。重要的是，FOSSS 通常由在职科学家（而非专业软件开发者）开发，鉴于典型学术工作场所的性质（其中学者，尤其是职业生涯早期的学者，处于短期固定期限合同中），这造成了一种不稳定的局面。在本文中，我们将论证现有的神经科学开源软件生态系统是脆弱的，并讨论神经科学界为何以及如何需要团结起来，确保我们的软件环境健康发展，以造福所有人。
引用
@article{arxiv.2403.19394,
title = {Cycling on the Freeway: The Perilous State of Open Source Neuroscience Software},
author = {Britta U. Westner and Daniel R. McCloy and Eric Larson and Alexandre Gramfort and Daniel S. Katz and Arfon M. Smith and invited co-signees},
journal= {arXiv preprint arXiv:2403.19394},
year = {2024}
}