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Crystal-LSBO:基于潜在空间贝叶斯优化的去核晶体自动设计

机器学习 2024-10-01 v2

摘要

生成式晶体结构模型因输入数据复杂性而面临重大挑战,这限制了这些模型探索和发现新晶体的能力。这种复杂性常将de novo设计方法局限于对已知晶体的小幅扰动,从而阻碍了先进优化技术的有效应用。一种此类优化技术——潜在空间贝叶斯优化(LSBO)在各类领域展现出探索新对象的潜力,尤其是在与变分自编码器(VAE)结合时效果尤为突出。鉴于LSBO的潜力以及创新晶体发现的关键需求,我们引入Crystal-LSBO,一种为LSBO框架量身定制的去核晶体设计方法,以增强其可探索性。Crystal-LSBO采用多个VAE,分别专注于晶体结构的不同方面:晶格、坐标和化学元素,由一个集成模型协调这些组件以产生连贯的输出。该设置不仅简化了学习过程,还通过降低每个模型学习任务的复杂性,产生可探索的潜在空间,从而使LSBO方法得以运作。我们的研究首次将LSBO用于去核晶体设计,通过以形成能值为主要优化目标的任务表明其有效性。我们的结果突显了该方法的有效性,为去核晶体发现提供了新的视角。

关键词

引用

@article{arxiv.2405.17881,
  title  = {Crystal-LSBO: Automated Design of De Novo Crystals with Latent Space Bayesian Optimization},
  author = {Onur Boyar and Yanheng Gu and Yuji Tanaka and Shunsuke Tonogai and Tomoya Itakura and Ichiro Takeuchi},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2405.17881},
  year   = {2024}
}

备注

10 pages, 5 figures