基于贝叶斯比对的跨物种生物网络分析

基因或蛋白质之间的复杂相互作用对表型演化贡献了相当大的一部分。在此我们开发了一种基于演化的方法，通过比对进行跨物种相互作用网络分析，其映射不同生物中基因间真实的功能关系。网络比对基于一个评分函数，衡量网络间的相互相似性，同时考虑其相互作用模式以及节点间的序列相似性。高分比对和最优比对参数通过系统的贝叶斯分析推断。我们将此方法应用于分析人与小鼠共表达网络的演化。我们发现了基因表达簇显著保守的证据，并给出基于网络的函数预测。我们讨论了跨物种基因功能关系与序列相似性不一致的实例。