COVID-19Base：一个探索COVID-19相关生物医学实体的知识库
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2021-03-17 v1 计算与语言
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摘要
我们提出COVID-19Base，一个基于文献挖掘、突出与COVID-19疾病相关生物医学实体的知识库。为开发COVID-19Base，我们从公开可用的科学文献和相关公共资源中挖掘信息。我们整合了七个主题专用词典，包括人类基因、人类miRNA、人类lncRNA、疾病、蛋白质数据库、药物及药物副作用，以挖掘所有与COVID-19相关的科学证据。我们采用一种新颖的自动化文献挖掘与标注系统，基于自然语言处理、情感分析和深度学习来衡量药物对疾病的有效性。据我们所知，这是首个致力于COVID-19的知识库，它通过文献挖掘整合了如此多种类的相关生物医学实体。对COVID-19Base中报告的这些被挖掘生物医学实体及其已识别相互作用的恰当研究，将有助于研究界发现COVID-19可能的治疗方法。
引用
@article{arxiv.2005.05954,
title = {COVID-19Base: A knowledgebase to explore biomedical entities related to COVID-19},
author = {Junaed Younus Khan and Md. Tawkat Islam Khondaker and Iram Tazim Hoque and Hamada Al-Absi and Mohammad Saifur Rahman and Tanvir Alam and M. Sohel Rahman},
journal= {arXiv preprint arXiv:2005.05954},
year = {2021}
}
备注
10 pages, 3 figures