膜蛋白通过弹性相互作用实现的协同门控与空间组织
亚细胞过程
2015-06-26 v1 定量方法
摘要
生物膜是弹性介质，其中跨膜蛋白的存在会导致局部双分子层变形。变形能使得两个邻近的膜蛋白能够通过其局部变形相互影响彼此的平衡构象，并基于几何形状对蛋白质进行空间组织。我们使用大电导机械敏感通道（MscL）作为案例研究，考察双分子层介导的弹性相互作用对蛋白质构象统计与聚集的影响。MscL周围的变形消耗约 10 kT 的能量，并从蛋白质边缘延伸约 3nm，因此弹性力诱导协同门控，我们提出实验来测量这些效应。此外，由于弹性相互作用与蛋白质构象相耦合，我们发现构象变化可严重改变两个蛋白质之间的平均间距。这对于构象变化如何在膜内将膜蛋白组织成功能组具有重要意义。
引用
@article{arxiv.q-bio/0702031,
title = {Cooperative Gating and Spatial Organization of Membrane Proteins through Elastic Interactions},
author = {Tristan Ursell and Kerwyn Huang and Eric Peterson and Rob Phillips},
journal= {arXiv preprint arXiv:q-bio/0702031},
year = {2015}
}
备注
12 pages, 6 figures, 63 references, submitted to PLoS Computational Biology