从生物模体构建最小DFA
形式语言与自动机理论
2010-12-10 v2 定量方法
摘要
确定性有限自动机（DFA）在计算生物学中为各种目的而构建。然而，最小DFA的高效构建却鲜受关注。在本文中，我们定义了简单非确定性有限自动机（NFA），并证明了标准子集构造法将此类型的NFA转换为最小DFA。此外，我们展示了如何从生物信息学中流行的两类模式构建简单NFA，即广义字符串（集合）和具有汉明邻域的（广义）字符串。
引用
@article{arxiv.1004.1298,
title = {Construction of minimal DFAs from biological motifs},
author = {Tobias Marschall},
journal= {arXiv preprint arXiv:1004.1298},
year = {2010}
}