中性和带电丙氨酸和甘氨酸链的构象性质

我们研究了由最多6个氨基酸组成的中性和带电丙氨酸和甘氨酸链的势能面。对于这些分子，我们计算了作为拉马钱德兰角φ和ψ函数的势能面。我们的计算在基于密度泛函理论的从头算理论框架内以及半经验模型方法中进行。我们证明了系统的过量正电荷强烈影响其几何和构象性质。随着过量电荷的增加，氨基酸链变得不稳定并衰变成两个或多个片段。我们分析了多肽链的二级结构如何影响势能景观的形成。我们计算了不同分子构象之间转变的能垒，并确定了能量上最有利的构象。