单调布尔函数即时邻居的计算
离散数学
2025-06-24 v2 分子网络
摘要
布尔网络是研究基因和信号网络行为的数学模型。这些网络定义了分子节点之间的调控影响,每个节点都与一个布尔变量和一个规制(局部)函数相关联,该函数指定其根据调节器的动态行为。然而,现有数据大多不足以充分参数化模型,即为每个节点唯一定义一个规制函数。为支持模型参数化,本文提出了一组与给定规制结构兼容的布尔函数的结果,即单调非退化布尔函数的部分有序集。更准确地说,我们提出了获取该集合中任何函数直接邻居的原始规则。除了理论兴趣外,所提出的结果将使开发更高效的布尔网络合成和修订方法成为可能,这些方法可从规制函数邻域的渐进式探索中受益。
引用
@article{arxiv.2407.01337,
title = {Computation of Immediate Neighbours of Monotone Boolean Functions},
author = {José E. R. Cury and Patrícia Tenera Roxo and Vasco Manquinho and Claudine Chaouiya and Pedro T. Monteiro},
journal= {arXiv preprint arXiv:2407.01337},
year = {2025}
}
备注
Accepted at CMSB 2025. 20 pages, 8 figures. arXiv admin note: text overlap with arXiv:1901.07623