补偿突变导致 RNA 二级结构折叠中拮抗上位性的过剩

背景：生物基因组在累积随机突变时适应度下降的速率是若干进化理论中的重要变量。直觉上，随机突变似乎自然倾向于协同相互作用，即随着随机突变数增加，平均适应度下降速率加快。然而，在近期若干研究中，观测到了拮抗上位性（多个突变具有缓解而非增强效应的趋势）的普遍盛行。结果：我们通过计算中性突变体比例随突变距离 d 的函数关系，在硅器中研究了 RNA 二级结构折叠中上位性相互作用的净量与形式。我们发现 RNA 二级结构折叠中拮抗上位性明显占优。通过将距离 d 处的中性突变体比例与距离 d 处的平均中性度相关联，我们表明该普遍性源自较大突变距离处存在大量补偿突变。结论：我们的发现意味着，简单适应度地形中上位性的平均方向直接关联于这些地形中适应度峰的分布密度。