稠密加权网络的社团：以 microRNA 共靶网络为例

Mahashweta Basu

稠密加权网络的社团：以 microRNA 共靶网络为例

分子网络 2014-01-16 v1 生物物理

作者: Mahashweta Basu

摘要

复杂网络本质上是模块化的。当网络连接稠密时，解析小模块尤为困难；链接权重的巨大差异带来了额外的复杂性。本文提出了一种在稠密连接加权网络中检测社团结构的算法。首先，通过删除权重大于截断值 $q$ 的链接来计算网络的模块度。然后取 $q=q_c$ （即模块度最大处）时获得的所有不相交组件，并使用针对加权网络的 Newman Girvan 算法对这些组件进行单独模块化。以智人的 microRNA (miRNA) 共靶网络为例，我们表明该算法能够揭示在生物学背景下已知具有相关性的 miRNA 模块。

关键词

加权网络社团检测 microRNA 共靶网络模块度复杂网络

引用

@article{arxiv.1401.3587,
  title  = {Communities of dense weighted networks: MicroRNA co-target network as an example},
  author = {Mahashweta Basu},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1401.3587},
  year   = {2014}
}

备注

14 pages, 6 eps figures

稠密加权网络的社团：以 microRNA 共靶网络为例

摘要

关键词

引用

备注

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