CollectionLocator 级别 1：基于元数据的联邦生物样本库集合检索
数据库
2024-08-30 v1
摘要
生物样本库是医学研究不可或缺的资源，收集生物材料及其相关数据，并使其对科研项目和医学研究开放。为此，生物样本库数据必须满足 certain criteria，这些条件可形式化为遵循 FAIR（可查找、可访问、可互操作且可重用）原则。我们开发了 CollectionLocator 工具，旨在通过支持研究人员识别在隐私限制下无法获取详细样本数据的情况下，哪些生物样本库及哪些集合可能包含满足特定研究项目要求的案例（材料和数据），来提高生物样本库数据的 FAIR 合规性。CollectionLocator 基于基于本体的元数据模型，以解决其中的巨大异质性问题，同时确保生物样本供体及其数据的隐私。此外，CollectionLocator 表示集合的数据和元数据质量，以便满足请求者的质量要求能够与可用数据的质量相匹配。CollectionLocator 的概念通过原型实现进行了评估。
引用
@article{arxiv.2408.16422,
title = {CollectionLocator Level 1: Metadata-Based Search for Collections in Federated Biobanks},
author = {Volodymyr A. Shekhovtsov and Bence Slajcho and Aron Sacherer and Johann Eder},
journal= {arXiv preprint arXiv:2408.16422},
year = {2024}
}