Coinami:一种以DNA序列比对作为工作量证明的加密货币
计算工程、金融与科学
2016-02-22 v2 密码学与安全
基因组学
摘要
使用高通量测序(HTS)平台所生成数据量的增长速度现已超过摩尔定律所规定的增长。预计在2025年之前,HTS数据将超过天文等其他“大数据”领域的数据。除了出于研究目的对基因组测序外,临床环境中的基因组和外显子组测序将成为医疗保健的常规部分。然而,分析如此大量的数据并非没有计算挑战。由于参考基因组的周期性更新(通常需要重新分析现有数据),这一负担进一步加剧。在此我们提出 Coin-Application Mediator Interface(Coinami),采用类似于伯克利网络计算开放基础设施(BOINC)的志愿网格计算机方法,来分发将读段比对到参考基因组的工作负载。然而,由于HTS读段比对需要大量计算资源且期望快速分析产出,Coinami将HTS读段比对作为工作量证明以生成有效区块,从而维持其自身的加密货币系统,这可能有助于激励志愿者投入更多资源。Coinami协议包含确保志愿者所执行任务正确的机制,并提供基因组数据隐私。Coinami的原型实现可在 http://coinami.github.io/ 获取。
引用
@article{arxiv.1602.03031,
title = {Coinami: A Cryptocurrency with DNA Sequence Alignment as Proof-of-work},
author = {Atalay M. Ileri and Halil I. Ozercan and Alper Gundogdu and Ahmet K. Senol and M. Yusuf Ozkaya and Can Alkan},
journal= {arXiv preprint arXiv:1602.03031},
year = {2016}
}