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粗粒化构象面跳跃:方法与可迁移性

软凝聚态物质 2021-02-03 v2 化学物理

摘要

粗粒化(CG)构象面跳跃(SH)将最初为描述化学反应中电子跃迁而发展的多面动力学概念加以改造,以在简化层面上准确描述经典分子动力学。SH 方案耦合不同的构象势阱(状态),每一个由其自身的力场(面)描述,从而显著改进了对多体平均力势的近似[Phys. Rev. Lett. 121, 256002 (2018)]。本研究首先通过玩具模型以及己烷的三珠模型更详细地描述 CG SH。我们进一步将该方法扩展到非键相互作用,并报告其对液体性质的影响。最后,我们通过简单调节状态概率,研究这些面在不同系统和热力学状态点上的可迁移性。特别地,对温度变化和化学组成变化的应用与参考全原子计算吻合良好,引入了有前景的“弱可迁移性机制”,其中 CG 力场可在热力学和化学邻域内共享。

关键词

引用

@article{arxiv.2009.08705,
  title  = {Coarse-grained conformational surface hopping: Methodology and transferability},
  author = {Joseph F. Rudzinski and Tristan Bereau},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2009.08705},
  year   = {2021}
}

备注

15 pages, 7 figures