Chem2Bio2RDF：面向化学生物学的关联开放数据门户
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2010-12-22 v1 其他定量生物学
摘要
Chem2Bio2RDF门户是一个面向系统化学生物学的关联开放数据(LOD)门户，旨在促进药物发现。它将大约25个关于基因、化合物、药物、通路、副作用、疾病和MEDLINE/PubMed文档的不同数据集转换为RDF三元组，并将它们链接到其他LOD数据圈，例如Bio2RDF、LODD和DBPedia。该门户基于D2R服务器，并提供一个SPARQL端点，但增加了一些独特功能，如RDF分面浏览器、用户友好的SPARQL查询生成器、MEDLINE/PubMed交叉验证服务和Cytoscape可视化插件。三个用例展示了该门户的功能和可用性。
引用
@article{arxiv.1012.4759,
title = {Chem2Bio2RDF: A Linked Open Data Portal for Chemical Biology},
author = {Bin Chen and David J Wild and Qian Zhu and Ying Ding and Xiao Dong and Madhuvanthi Sankaranarayanan and Huijun Wang and Yuyin Sun},
journal= {arXiv preprint arXiv:1012.4759},
year = {2010}
}
备注
8 pages, 10 figures