CHAMPION：查尔姆斯分层原子、分子、聚合物与离子分析工具包
化学物理
2021-02-04 v1
摘要
我们推出 CHAMPION：一款基于原子动力学自动检测原子间时变键、分类其周围局部图拓扑、并通过统计物理分析这些拓扑的物理化学性质的软件。与基于截止距离等静态条件检测键的方法截然不同，CHAMPION 仅当原子对随时间共同运动并表现为束缚对时才认为其成键。此外，时变全局键图可拆分为围绕某一化学基元的动态漂移连通分量或子图，从而允许通过统计物理分析各此类拓扑的物理化学性质。该工具普遍适用于凝聚态与液体，尤其适用于电解质，可对局部结构以及如物种形成与扩散等动力学过程进行定量与定性描述。我们在此给出 CHAMPION 的详尽概述，包括其底层方法、实现与能力。
引用
@article{arxiv.2102.01768,
title = {CHAMPION: Chalmers Hierarchical Atomic, Molecular, Polymeric & Ionic Analysis Toolkit},
author = {Rasmus Andersson and Fabian Årén and Alejandro A. Franco and Patrik Johansson},
journal= {arXiv preprint arXiv:2102.01768},
year = {2021}
}
备注
11 pages, 8 figures