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海湾战争疾病研究中生物标志物发现与生物样本库面临的挑战:一种新型数据平台解决方案

计算机与社会 2021-02-19 v3

摘要

目的:我们的海湾战争疾病(GWI)研究对许多相互作用的神经与体液生物标志物进行组合筛选,以建立预测、诊断与治疗靶点。由于研究复杂性及缺乏对复杂数据问题解决方案的支持,我们在生物标志物发现过程的每个阶段——从样本获取、生物标志物提取到多方面多向交互分析——都遇到障碍。我们引入一种名为 ROSALIND 的新型数据平台来克服这些挑战,促进健康而活跃的协作并推进科学探究。主要方法:ROSALIND 是一个以研究者为中心、特定于研究的数据平台。它为协作研究中个人创造力与努力提供重要支持。我们遵循镌刻于平台名称中的原则——ROSALIND 代表具有自治理可访问性、可链接性、可集成性、中立性与可靠性的资源有机体。我们通过先进概念与技术的创新运用对原则进行转化、编码与实现,以确保并保护数据完整性与研究完整性。从研究者视角,ROSALIND 在一个系统中体现了精细效用与先进功能,超越常规存储、归档与数据管理。主要发现:ROSALIND 在我们 GWI 研究中近 12 个月的部署加速了数据实验与分析步伐,消除了大量错误源,并提升了研究质量与生产力。意义:ROSALIND 似乎是首个以数字化措施与手段同步解决数据完整性与研究完整性的平台。它还预示了一种新型分布式研究网络,其中个体化数据平台以各种自组织协作配置相连。

关键词

引用

@article{arxiv.2102.02878,
  title  = {Challenges in biomarker discovery and biorepository for Gulf-war-disease studies: a novel data platform solution},
  author = {Dimitris Floros and Mulugu V. Brahmajothi and Alexandros-Stavros Iliopoulos and Nikos Pitsianis and Xiaobai Sun},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2102.02878},
  year   = {2021}
}

备注

Authorship disagreement