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细胞群集:一种早期演化细胞分选模型及其在黏菌 D. discoideum 中的应用

种群与进化 2019-02-21 v1 细胞行为

摘要

本文提出了一个关于细胞聚集体内早期演化细胞分选的理论模型。该模型涉及一种节能机制以及类似于在自行车群(骑行者群体)中观察到的集体自组织原理。该理论框架被应用于黏菌蛞蝓(Dictyostelium discoideum),并纳入计算机模拟中,主要展示了细胞在前部和后部蛞蝓区域之间的分选。该模拟依赖于已有的自行车群动力学模拟,并对其进行修改以纳入异质细胞中有限范围的细胞代谢能力,以及一个可调的能量消耗参数,称为“输出水平”或“饥饿水平”以反映能量供应的递减;对原细胞动力学建模了三个输出阶段:“活跃”、“受损”和“死亡或已死”。调整饥饿参数导致细胞分化并在细胞聚集体内分选为子群。对饥饿参数的调节展示了弱细胞或衰亡细胞如何在细胞聚集体内向后移动。

关键词

引用

@article{arxiv.1902.07601,
  title  = {Cell pelotons: a model of early evolutionary cell sorting, with application to slime mold D. discoideum},
  author = {Hugh Trenchard},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1902.07601},
  year   = {2019}
}

备注

41 pages, 8 figures, 1 appendix, accepted manuscript in press