我们能否总是将 RNA 加工的细节掩盖过去？
定量方法
2015-06-15 v3 分子网络
摘要
RNA 分子从转录到成熟遵循一系列酶介导的加工步骤。参与加工的酶（例如 mRNA 的剪接体以及 microRNA 的 Drosha 和 Dicer）也在细胞中产生，其拷贝数随时间波动。酶拷贝数的变化会影响底物分子的加工速率；高酶数量增加加工概率，低酶数量则降低之。我们研究了酶拷贝数固定或波动的不同 RNA 加工级联过程。我们发现，对于固定的酶拷贝数，稳态下的底物服从泊松分布，整个 RNA 级联动力学可理解为成熟 RNA 产物的单一出生 - 死亡过程。在这种情况下，仅 RNA 加工时间的波动会导致 RNA 分子数量的变化。然而，我们通过解析和数值分析表明，当酶拷贝数波动时，RNA 波动的强度随 RNA 转录速率线性增加。随着酶动力学速度相对于 RNA 动力学速度的降低，这种线性效应变得更强。有趣的是，我们发现特定条件下，RNA 级联可以降低成熟 RNA 产物表达水平波动的强度。最后，通过研究加工多态性的影响，我们表明转录多态性的影响可能被增强、减弱甚至逆转。我们的结果为理解 RNA 加工动力学提供了一个框架。
引用
@article{arxiv.1304.4460,
title = {Can we always sweep the details of RNA-processing under the carpet?},
author = {Filippos D. Klironomos and Juliette de Meaux and Johannes Berg},
journal= {arXiv preprint arXiv:1304.4460},
year = {2015}
}