Python中的生灭过程：BirDePy包
统计方法学
2021-10-12 v1 概率论
种群与进化
摘要
生灭过程(BDPs)构成一类连续时间马尔可夫链，特别适用于描述种群规模随时间的变化。种群规模依赖的生灭过程(PSDBDPs)允许种群增长速率依赖于当前种群规模。我们的新Python包BirDePy的主要目的在于提供易用的函数，以估计离散观测的PSDBDPs的参数。该包也可用于估计连续观测的PSDBDPs的参数、模拟样本路径、近似转移概率并生成预测。我们详细描述了已集成到BirDePy中以完成上述各项任务的数种方法。通过多种PSDBDPs示例以及涉及两种濒危鸟类年度种群计数数据的案例研究，展示了该包的使用方式与有效性。
引用
@article{arxiv.2110.05067,
title = {Birth-and-death Processes in Python: The BirDePy Package},
author = {Sophie Hautphenne and Brendan Patch},
journal= {arXiv preprint arXiv:2110.05067},
year = {2021}
}