具有S型响应的生化滤波器:增加生物分子逻辑的复杂性
生物物理
2010-11-09 v1 软凝聚态物质
其他计算机科学
化学物理
分子网络
摘要
本文报道并分析了一种人为设计的(而非天然的)生化滤波过程的首次实现,该过程作为有前景的网络组件,用于增加生物分子逻辑系统的复杂性。生化逻辑研究的关键挑战一直是实现复杂网络设计的可扩展性。各种逻辑门已经实现,但用于互连和信号处理的模拟元件“工具箱”仍然难以获得。滤波器作为网络元件非常重要,它允许控制信号传输和转换中的噪声。我们报告了一种多功能的生化滤波机制,该机制设计为具有S型响应并结合了信号转换过程。通过添加抗坏血酸,改变了辣根过氧化物酶催化过氧化氢氧化显色电子供体的过程,从而可以选择性地抑制输出信号,将响应从凸形修改为S形。我们开发了一个动力学模型来评估滤波质量。该结果为设计可扩展的生物分子信息处理系统提供了改进的能力。
引用
@article{arxiv.1009.2287,
title = {Biochemical Filter with Sigmoidal Response: Increasing the Complexity of Biomolecular Logic},
author = {Vladimir Privman and Jan Halamek and Mary A. Arugula and Dmitriy Melnikov and Vera Bocharova and Evgeny Katz},
journal= {arXiv preprint arXiv:1009.2287},
year = {2010}
}
备注
24 pages, PDF