大数据技术加速基因组学精准医学
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2017-02-01 v1
摘要
在基因组学生命科学研究中，全基因组学和生命科学算法的数据量变得越来越大，以TB、PB或EB等计量。关键问题将是如何以优化的方式存储和分析数据。本文展示了Intel大数据技术与架构如何帮助促进并加速基因组学生命科学研究中的数据存储与利用。Intel定义了用于变异调用数据查询的高性能GenomicsDB，以及带有Hierarchal Storage Management的Lustre filesystem用于基因组学数据存储。基于这些优秀技术，Intel定义了基因组学知识共享与交换架构，该架构已在BGI China和Shanghai Children Hospital落地并验证，获得了非常积极的反馈。并且这些大数据技术肯定可以扩展到全球更多的基因组学生命科学合作伙伴。
引用
@article{arxiv.1701.09045,
title = {Big Data Technology Accelerate Genomics Precision Medicine},
author = {Hao Li},
journal= {arXiv preprint arXiv:1701.09045},
year = {2017}
}