数字微流控平台上用于 DNA 存储的液滴自动路由
新兴技术
2023-07-07 v5
摘要
过去三十年间，DNA 测序（读取）和合成（写入）技术沿着类似摩尔定律的轨迹发展。这激发了利用 DNA 进行数据存储的想法。理论上，基于 DNA 的存储系统可以超越所有现有的归档存储形式。然而，在读写速度的理论可能性与实际已用 DNA 演示的结果之间，存在着巨大差距。本文介绍了一种新的 DNA 存储方法，即在数字微流控生物芯片上进行自动化组装。该技术利用“符号”和“连接子”的双库，在 DNA 组装中提供了前所未有的并行性。针对管理设备上液滴交通的问题，讨论了一种算法解决方案，采用带优先级的三维“A*”路由。概述了为在设备上并行路由大量液滴、最小化拥塞并最大化吞吐量而开发的软件。
引用
@article{arxiv.2211.15494,
title = {Automated Routing of Droplets for DNA Storage on a Digital Microfluidics Platform},
author = {Ajay Manicka and Andrew Stephan and Sriram Chari and Gemma Mendonsa and Peyton Okubo and John Stolzberg-Schray and Anil Reddy and Marc Riedel},
journal= {arXiv preprint arXiv:2211.15494},
year = {2023}
}
备注
15 pages, 23 figures. Submitted to the journal "Lab on a Chip" for publication by the Royal Society of Chemistry