通过反应坐标网络的杂聚物组装
统计力学
2019-12-18 v3
摘要
在生物化学中，编码生物信息的杂聚物通过依次掺入环境中可用单体而在非平衡状态下组装。当前的聚合模型将单体掺入视为中间亚稳态之间的一系列离散化学反应。本文中，我们利用反应速率理论的思想，通过连续反应坐标描述杂聚物的非平衡组装。我们的方法允许从过程的吉布斯自由能景观估算拷贝错误和掺入速度。我们将理论应用于若干例子，从由自由能垒表征的简单反应，到包含如动力学校对之类纠错机制的更复杂情形。
引用
@article{arxiv.1906.05490,
title = {Assembly of heteropolymers via a network of reaction coordinates},
author = {Davide Chiuchiù and James Ferrare and Simone Pigolotti},
journal= {arXiv preprint arXiv:1906.05490},
year = {2019}
}
备注
24 pages, 7 figures