实时移动 DNA 分析的应用与挑战
计算工程、金融与科学
2019-01-09 v1 分布式、并行与集群计算
基因组学
摘要
DNA 测序是确定给定 DNA 分子内核苷酸精确顺序的过程。新型便携式且相对廉价的 DNA 测序仪（如 Oxford Nanopore MinION）有潜力将 DNA 测序移出实验室，从而实现更快速且更易获取的基于 DNA 的诊断。然而，由于高数据吞吐量和在连接与供电不可靠的环境中进行的计算密集型处理，便携式 DNA 测序与分析对移动系统而言具有挑战性。在本文中，我们分析了移动系统与移动计算必须应对的挑战，以最大化便携式 DNA 测序及原位 DNA 分析的潜力。我们解释了 DNA 测序过程，并在实际与预期应用的背景下强调了传统与便携式 DNA 测序的主要差异。我们从算法与系统设计的视角审视所识别的挑战，显示出精心协同设计的必要性。
引用
@article{arxiv.1711.07370,
title = {Applications and Challenges of Real-time Mobile DNA Analysis},
author = {Steven Y. Ko and Lauren Sassoubre and Jaroslaw Zola},
journal= {arXiv preprint arXiv:1711.07370},
year = {2019}
}