1200万年古代 Lycoptera 化石中的原始 DNA 揭示进化视角
基因组学
2024-12-10 v1
摘要
高品质古代 DNA (aDNA) 对分子化石学至关重要。由于 DNA 降解和受环境 DNA (eDNA) 污染,当前研究受限于小于 100 万年的化石。本研究成功提取了早期白垩纪化石中 Lycoptera davidi 的 DNA,年代约 1.2 亿年。通过高通量测序,获得了 1,258,901 条 DNA 序列。我们建立了称为巨型筛选法的严格方法。使用该方法,我们识别出 243 条原位 DNA (oriDNA) 序列,可能来自 Lycoptera 基因组。这些序列平均长度为 100 条核苷酸以上,未显示脱氨迹象。此外,还发现了 10 条转座子编码序列,为理解该基因组中独特的自更新机制提供了线索。该研究为理解古代鱼类的演化提供了宝贵的 DNA 数据,推动了化石学研究的发展。
引用
@article{arxiv.2412.06521,
title = {Ancient DNA from 120-Million-Year-Old Lycoptera Fossils Reveals Evolutionary Insights},
author = {Wan-Qian Zhao and Zhan-Yong Guo and Zeng-Yuan Tian and Tong-Fu Su and Gang-Qiang Cao and Zi-Xin Qi and Tian-Cang Qin and Wei Zhou and Jin-Yu Yang and Ming-Jie Chen and Xin-Ge Zhang and Chun-Yan Zhou and Chuan-Jia Zhu and Meng-Fei Tang and Di Wu and Mei-Rong Song and Yu-Qi Guo and Li-You Qiu and Fei Liang and Mei-Jun Li and Jun-Hui Geng and Li-Juan Zhao and Shu-Jie Zhang},
journal= {arXiv preprint arXiv:2412.06521},
year = {2024}
}
备注
14 pages,3 Figures