家畜线粒体基因组需要仔细审查
种群与进化
2014-07-17 v1
摘要
GenBank 中已收录了八种常见家畜（即牛、狗、山羊、马、猪、绵羊、牦牛和鸡）及其近缘野生祖先或亲属的 1000 多条完整或近乎完整的线粒体 DNA (mtDNA) 序列。然而，很少有人努力评估序列数据的质量，而这严重影响原始结论。在此，我们基于这八种动物的 mtDNA 单倍群树，对这些完整或近乎完整的 mtDNA 序列进行了系统发育调查。我们表明，由于人工重组、突变过剩和幻象突变导致的错误确实存在于 14.5% (194/1342) 的 mtDNA 序列中，应予以广泛警惕。我们就未来家畜 mtDNA 研究提出了一些注意事项。
引用
@article{arxiv.1407.4116,
title = {Mitochondrial Genomes of Domestic Animals Need Scrutiny},
author = {Ni-Ni Shi and Long Fan and Yong-Gang Yao and Min-Sheng Peng and Ya-Ping Zhang},
journal= {arXiv preprint arXiv:1407.4116},
year = {2014}
}
备注
129 Pages, 1 figure, 3 tables, and 5 supplementary materials