利用数字化组织病理学图像分析具有不同突变谱星形细胞瘤的细胞特征差异
计算机视觉与模式识别
2018-06-26 v1
摘要
从组织病理学图像中衍生的细胞表型特征是病理诊断的基础，并被认为与潜在的分子谱相关。由于细胞数量庞大且群体异质性高，定量计算并比较具有不同分子特征的细胞特征仍具挑战性。本研究中，我们提出一个自主且高效的分析框架，支持跨不同分子组的细胞表型差异定量分析。为证明有效性，我们利用来自癌症基因组图谱数据库(The Cancer Genome Atlas)的影像数据，对分子表征为异柠檬酸脱氢酶(IDH)突变型(MUT)或野生型(WT)的星形细胞瘤进行定量分析。在经过分割、特征计算、数据剪枝、降维和无监督聚类后，检索出两组间表型不同的代表性细胞实例。我们的分析具有通用性，可应用于广泛的基于细胞的生物医学研究。
引用
@article{arxiv.1806.09093,
title = {Analysis of Cellular Feature Differences of Astrocytomas with Distinct Mutational Profiles Using Digitized Histopathology Images},
author = {Mousumi Roy and Fusheng Wang and George Teodoro and Jose Velazqeuz Vega and Daniel Brat and Jun Kong},
journal= {arXiv preprint arXiv:1806.09093},
year = {2018}
}