蓝细菌丝状体中异形胞模式形成的建模与模拟综合方法
细胞行为
2015-04-30 v1 分子网络
摘要
本文开发了一种针对蓝细菌细胞分化的综合方法。为此，我们从系统生物学的角度研究了异形胞细胞的形成过程。依靠统计物理学技术，我们将遗传电路的基本要素和机制转化为一组微分方程，描述了结合氮、PatS、HetR 和 NtcA 浓度的连续时间演化。对这些方程的详细分析揭示了单细胞动力学。另一方面，包含扩散和噪声条件使得能够模拟蓝细菌菌株中异形胞模式的形成。计算了相关组分浓度的时间演化，以便与实验进行比较。最后，我们讨论了模型的有效性及其可能的改进。
引用
@article{arxiv.1408.1085,
title = {An integrative approach for modeling and simulation of Heterocyst pattern formation in Cyanobacteria strands},
author = {Alejandro Torres-Sanchez and Jesus Gomez-Gardenes and Fernando Falo},
journal= {arXiv preprint arXiv:1408.1085},
year = {2015}
}
备注
20 pages (including the supporting information), 8 figures