一种用于单个活体金黄色葡萄球菌细胞分割和分裂平面检测的自动化图像分析框架，可在毫秒采样时间尺度上使用定制的 Slimfield 显微镜进行操作
生物物理
2016-10-21 v1
摘要
金黄色葡萄球菌是一种重要的病原体，在诸如耐甲氧西林金黄色葡萄球菌 (MRSA) 等细胞株中产生抗菌素耐药性。本文报道了一种图像分析框架，用于自动检测和分割金黄色葡萄球菌细胞簇中的细胞，并明确识别其细胞分裂平面。我们使用了几种现有图像分析工具的新组合，以单分子检测精度，从活体病原体的毫秒时间尺度采样图像中检测与细胞分裂相关的细胞和亚细胞形态特征。我们使用与蛋白 EzrA 融合的荧光报告基因 GFP 来演示这种方法，EzrA 在分裂期间定位于细胞中部平面，并参与细胞大小和分裂的调控。该图像分析框架为研究靶向细胞分裂机制的新型候选抗菌药物提供了一个有价值的平台，但也可能在检测其他类型细胞簇中存在的荧光标记蛋白的形态复杂结构方面具有更广泛的应用。
引用
@article{arxiv.1610.06361,
title = {An automated image analysis framework for segmentation and division plane detection of single live Staphylococcus aureus cells which can operate at millisecond sampling time scales using bespoke Slimfield microscopy},
author = {Adam J. M. Wollman and Helen Miller and Simon Foster and Mark C. Leake},
journal= {arXiv preprint arXiv:1610.06361},
year = {2016}
}
备注
arXiv admin note: text overlap with arXiv:1603.00695