n层信号级联的代数方法
定量方法
2010-12-21 v2 分子网络
摘要
蛋白质的翻译后修饰是细胞内信号传递的关键。许多信号通路包含多层修饰循环，这些循环介导并改变通过通路的信号。在此，我们研究一个由n层修饰循环组成的简单信号级联，其中一层的修饰蛋白作为下一层的修饰剂。假设质量作用动力学并考虑中间复合物的形成，我们证明稳态是单变量多项式的解，并且实际上对于任何给定的底物和酶总量，恰好存在一个稳态。我们证明许多稳态浓度通过有理函数相关联，这些函数可以递归地找到。例如，刺激-响应曲线作为显式有理函数的反函数出现。我们表明，随着我们沿级联向下移动，修饰底物的刺激-响应曲线向左移动。此外，我们的方法使我们能够研究酶竞争、隔离以及稳态如何响应底物总量的变化。我们的方法本质上是代数的，并遵循翻译后修饰系统研究的最新趋势。
引用
@article{arxiv.1008.0431,
title = {An Algebraic Approach to Signaling Cascades with n Layers},
author = {Elisenda Feliu and Michael Knudsen and Lars N. Andersen and Carsten Wiuf},
journal= {arXiv preprint arXiv:1008.0431},
year = {2010}
}