聚合 Knockoffs 以控制错误发现率及其在肠道微生物组数据中的应用
统计方法学
2021-03-02 v2 定量方法
应用统计
摘要
近期的发现表明我们的肠道微生物组在健康和福祉中扮演重要角色。然而,肠道微生物组数据十分复杂;例如,肠道中的微生物多样性使数据为高维。尽管有专门的高维方法,如 lasso 估计量,它们总是伴随错误发现的风险。Knockoffs 是近期一种控制错误发现数量的方法。在本文中,我们展示 knockoffs 可以被聚合以在保持对错误发现的严格控制的同时提高功效。我们从理论和模拟上支持我们的方法,并展示它能在来自 American Gut Project 的微生物组数据上带来新发现。特别地,我们的结果表明几个迄今被忽视的菌门与肥胖相关。
引用
@article{arxiv.1907.03807,
title = {Aggregating Knockoffs for False Discovery Rate Control with an Application to Gut Microbiome Data},
author = {Fang Xie and Johannes Lederer},
journal= {arXiv preprint arXiv:1907.03807},
year = {2021}
}