加速、超加速与减速概率网络
分子网络
2017-12-22 v1 定量方法
摘要
许多生长网络具有加速统计量,其中每个新节点添加的链接数是网络规模的增函数,因此链接总数随网络规模比线性更快地增加。特别是,生物网络可展现调控因子数随基因组规模的二次增长,同时仍保持稀疏连接。这些特征在标准网络理论处理中相互不兼容,后者通常要求每个新网络节点至少拥有一个连接。为对稀疏连接网络建模,我们推广现有方法,以概率性链接数添加每个新节点,从而在不同 regime 下生成加速、超加速甚至减速的网络统计量。例如在优先连接下,缓慢加速网络展现相对独立于网络规模的稳态无标度统计量,而更快速加速网络随网络增长展现从无标度到指数统计量的转变。此类转变解释了例如单细胞生物的演化记录,其展现严格的大小与复杂性限制。
引用
@article{arxiv.q-bio/0502013,
title = {Accelerating, hyper-accelerating, and decelerating probabilistic networks},
author = {M. J. Gagen and J. S. Mattick},
journal= {arXiv preprint arXiv:q-bio/0502013},
year = {2017}
}
备注
13 pages, 9 figures