用于分析表型、遗传与地理数据的统一模型
种群与进化
2011-12-22 v1 定量方法
应用统计
统计计算
摘要
识别进化单元（物种、种群）需要整合多种数据，如遗传或表型标记或空间信息，以获得关于这些单元分化的全面认识。我们提出了一个具有双重原创优势的统计模型：(i) 它纳入了关于样本空间分布的信息，旨在提高推断能力，并将观察到的模式更明确地与地理联系起来；(ii) 它允许在统一的模型和推断框架内分析遗传和表型数据，从而为标记间的稳健比较以及可能的联合分析开辟了道路。我们通过模拟数据以及文献中的真实数据表明，我们的方法能准确估计参数，并在许多情况下优于其他替代方法。基于从瑞典的 {\em Myodes} 田鼠中获得的地理参考遗传和形态测量标记的原始数据集，我们以一个种间与种内分化的复杂案例展示了该方法的实用性。作为 R 包 Geneland 的扩展，提供了一个可用的计算机程序。
引用
@article{arxiv.1112.5006,
title = {A Unifying Model for the Analysis of Phenotypic, Genetic and Geographic Data},
author = {Gilles Guillot and Sabrina Renaud and Ronan Ledevin and Joahn Michaux and Julien Claude},
journal= {arXiv preprint arXiv:1112.5006},
year = {2011}
}