自然语言处理在放射学报告中的应用:系统性综述
计算与语言
2021-06-10 v1
摘要
NLP 在推进医疗保健方面具有重要作用,并且已被证明是从放射学报告中提取结构化信息的关键。理解 NLP 在放射学应用中的最新进展具有重要意义,但近期关于此方面的综述十分有限。本研究系统性地评估了 NLP 应用于放射学报告的最新文献。我们的自动化文献检索结合手动审查,使用自动过滤、元数据丰富步骤和引文搜索,产生了 4,799 条结果。我们的分析基于 21 个变量,包括放射学特征、NLP 方法、性能、研究和临床应用特征。我们对检索到的 164 篇出版物进行了全面分析,每篇被归类到 6 个临床应用类别之一。深度学习的使用在增加,但传统的机器学习方法仍然普遍。在数据稀缺时深度学习仍面临挑战,并且几乎没有证据表明其已投入临床应用。尽管 17% 的研究报告了大于 0.85 的 F1 分数,但由于大多数研究使用不同的数据集,很难对这些方法进行比较评估。仅有 14 项研究公开了数据,15 项公开了代码,10 项进行了外部验证。对放射学报告临床叙述的自动理解有潜力增强医疗流程,但如果该领域要将应用推向临床使用,模型的可复现性和可解释性十分重要。可以做得更多以共享代码,从而能够在不同机构数据上验证方法,并减少研究属性报告中的异质性,以便进行跨研究比较。我们的结果对研究人员具有重要意义,提供了对现有工作的系统性综合,以便在此基础上发展、识别差距、合作机会并避免重复。
引用
@article{arxiv.2102.09553,
title = {A Systematic Review of Natural Language Processing Applied to Radiology Reports},
author = {Arlene Casey and Emma Davidson and Michael Poon and Hang Dong and Daniel Duma and Andreas Grivas and Claire Grover and Víctor Suárez-Paniagua and Richard Tobin and William Whiteley and Honghan Wu and Beatrice Alex},
journal= {arXiv preprint arXiv:2102.09553},
year = {2021}
}