一种超可扩展的短片段检测算法
统计方法学
2020-03-30 v1 应用统计
统计计算
摘要
在诸如拷贝数变异（CNV）检测等许多应用中，目标是识别观测值具有不同于背景的均值或中位数的短片段。这些片段通常较短且隐藏于长序列中，因此极难发现。本文研究一种超可扩展短片段（4S）检测算法。该非参数方法对观测值超过阈值的位置进行聚类以检测片段。其计算高效且不依赖高斯噪声假设。此外，我们发展了一个框架为检测到的片段赋予显著性水平。我们通过理论、模拟与真实数据研究展示了所提方法的优势。
引用
@article{arxiv.2003.12540,
title = {A super scalable algorithm for short segment detection},
author = {Ning Hao and Yue Selena Niu and Feifei Xiao and Heping Zhang},
journal= {arXiv preprint arXiv:2003.12540},
year = {2020}
}
备注
To be published in Statistics in Biosciences