用于拷贝数变异检测的逆序变点检测方法
应用统计
2019-08-20 v2
摘要
变点检测近期因分析阵列或测序数据以进行拷贝数变异(CNV)检测而重新受到大量关注。在此类应用中,真实信号通常非常短且埋藏在长数据序列中,这使得高效且准确地识别变异具有挑战性。在本文中,我们提出一种新的变点检测方法——逆序过程,它不仅快速简单足以利用高维数据,而且在检测短信号方面表现非常好。尽管由 CNV 检测所启发,逆序过程普遍适用于在各种科学应用中出现的各类变点问题。通过模拟和真实 CNV 数据的说明,逆序检测相对于其他竞争方法具有明显优势,尤其在真实信号较短时。
引用
@article{arxiv.1812.10107,
title = {A backward procedure for change-point detection with applications to copy number variation detection},
author = {Seung Jun Shin and Yichao Wu and Ning Hao},
journal= {arXiv preprint arXiv:1812.10107},
year = {2019}
}