聚合物链折叠的字符串反应坐标
软凝聚态物质
2016-08-17 v1 统计力学
计算物理
摘要
我们研究具有短程吸引力的单条柔性同聚物链的结晶机制。对于足够窄的吸引势阱，系统经历一个类似一级的冻结转变，从膨胀的无序线团变为致密的晶体状态。基于由Wang-Landau采样获得的构型所计算的承诺值(committor values)的极大似然分析，我们构建了用于线团到晶体转变的非线性字符串反应坐标。与线性反应坐标相比，字符串反应坐标捕捉了控制转变不同阶段的自由度的不同效应。我们的分析表明，能量与全局结晶度参数Q6的组合为该转变进程提供了最精确的度量。虽然结晶度参数Q6在结晶初始阶段最为相关，但后期阶段由势能的降低主导。
引用
@article{arxiv.1501.03936,
title = {A string reaction coordinate for the folding of a polymer chain},
author = {Christian Leitold and Wolfgang Lechner and Christoph Dellago},
journal= {arXiv preprint arXiv:1501.03936},
year = {2016}
}
备注
Accepted in Journal of Physics: Condensed Matter, article reference JPCM-103240.R1