由准确性、多样性和成本相互作用驱动的分子密码进化的简单模型
定量方法
2010-07-26 v1 信息论
math.IT
生物物理
摘要
分子密码将一种类型分子中编码的信息翻译成另一种分子语言。我们引入了一个简单模型,将分子密码视为噪声信息通道。最优密码是一个能够准确高效地传递信息,同时降低错误影响的通道。对最小错误负荷、最小资源成本和最大词汇多样性这三个相互冲突需求的平衡,定义了密码的适应度。该模型提出了一种密码涌现的机制,即当进化改变控制这种平衡的参数,并且两种分子语言之间的映射变得非随机时。这种机制通过一个简单的玩具模型得以展示,该模型在形式上等价于平均场伊辛磁体。
引用
@article{arxiv.1007.4124,
title = {A simple model for the evolution of molecular codes driven by the interplay of accuracy, diversity and cost},
author = {Tsvi Tlusty},
journal= {arXiv preprint arXiv:1007.4124},
year = {2010}
}
备注
Keywords: molecular codes, rate-distortion theory, biological information channels, stochastic maps, genetic code, genetic networks