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一种支持多暴露、多变量中介与非线性响应模型的中介分析框架

统计方法学 2020-11-13 v1

摘要

中介分析旨在识别并量化暴露影响结局的路径。受暴露影响且影响结局的中间变量被称为中介变量。在单一中介以及连续与二值结局模型的背景下,中介分析已有大量研究。然而,这些方法通常不适用于包含高度互联的、测量生物机制的多组学数据,以及各类结局变量(如删失生存响应)。在本文中,我们开发了一个通用的因果中介分析框架,支持多暴露、多变量中介,以及连续、二值和生存响应。我们依据不同结局模型的适用性,在多种尺度上估计中介效应,包括均值差、优势比和受限均值尺度。我们的估计方法避免了对模型参数(如罕见疾病假设)施加约束,同时兼容连续暴露。我们通过广泛的模拟研究评估该框架并与其他方法比较,在不同样本量、疾病患病率和假中介数量下考察偏倚、一类错误和功效。利用来自癌症基因组图谱的肾透明细胞癌数据,我们识别了介导代谢基因表达对生存影响的蛋白质。实现这一统一框架的软件已作为 R 包提供(https://github.com/longjp/mediateR)。

关键词

引用

@article{arxiv.2011.06061,
  title  = {A Framework for Mediation Analysis with Multiple Exposures, Multivariate Mediators, and Non-Linear Response Models},
  author = {James P. Long and Ehsan Irajizad and James D. Doecke and Kim-Anh Do and Min Jin Ha},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2011.06061},
  year   = {2020}
}

备注

17 pages, 5 figures