用于从多对比度 MRI 中检测胼胝体异常及遗传关联的综合胼胝体分割工具
定量方法
2023-05-03 v1
摘要
中矢状面胼胝体(midCC)的结构改变与多种脑疾病相关。midCC 在大多数 MRI 对比度图像上可见,且在许多视野有限的采集中也能显示。在此,我们提出一种从 T1w、T2w 和 FLAIR 图像中分割并评估 midCC 形状的自动化工具。我们在多个公共数据集的图像上训练 UNet 以获得 midCC 分割结果。同时内置一个基于 midCC 形状特征训练的质量控制算法。我们在重测数据集中计算组内相关系数(ICC)和平均 Dice 分数以评估分割的可靠性。我们在低质量和部分脑扫描上测试我们的分割方法。我们利用来自 UK Biobank 超过 40,000 个体的数据凸显所提取特征的生物学意义;我们对临床定义的形状异常进行分类并进行遗传分析。
引用
@article{arxiv.2305.01107,
title = {A Comprehensive Corpus Callosum Segmentation Tool for Detecting Callosal Abnormalities and Genetic Associations from Multi Contrast MRIs},
author = {Shruti P. Gadewar and Elnaz Nourollahimoghadam and Ravi R. Bhatt and Abhinaav Ramesh and Shayan Javid and Iyad Ba Gari and Alyssa H. Zhu and Sophia Thomopoulos and Paul M. Thompson and Neda Jahanshad},
journal= {arXiv preprint arXiv:2305.01107},
year = {2023}
}