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针对高度不平衡目标尺寸的带指数对数损失的3D分割

计算机视觉与模式识别 2018-09-26 v2

摘要

随着全卷积神经网络的引入,深度学习在医学图像分割的速度与精度上提升了基准,并且针对2D和3D分割已提出不同网络并取得了有前景的结果。然而,大多数网络仅处理相对较少的标签数量(<10),且关于处理高度不平衡目标尺寸的工作非常有限,尤其是在3D分割中。本文中,我们提出一种网络架构及相应的损失函数,以改善对极小结构的分割。通过结合跳跃连接与深度监督,并顾及3D分割的计算可行性,我们提出了一种快速收敛且计算高效的网络架构以实现精确分割。此外,受focal loss概念的启发,我们提出一种指数对数损失,其不仅依据标签的相对尺寸,还依据其分割难度来平衡标签。我们在具有20个标签的脑分割上取得了82%的平均Dice系数,其中最小与最大目标尺寸之比仅为0.14%。达到该精度所需训练轮数少于100 epoch,且分割一个128x128x128体素仅需约0.4 s。

关键词

引用

@article{arxiv.1809.00076,
  title  = {3D Segmentation with Exponential Logarithmic Loss for Highly Unbalanced Object Sizes},
  author = {Ken C. L. Wong and Mehdi Moradi and Hui Tang and Tanveer Syeda-Mahmood},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1809.00076},
  year   = {2018}
}

备注

Accepted by the International Conference on Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention - MICCAI 2018 (oral presentation, acceptance rate 4%)