Xsorb：一种用于识别晶体表面分子最稳定吸附构型与吸附能的软件
材料科学
2023-08-16 v1
摘要
分子吸附是从催化到摩擦学等许多表面介导化学过程的首要重要步骤。该现象由物理/化学相互作用控制，这些相互作用可通过第一性原理计算精确描述。近年来，已开发出若干基于高通量/自动化方法的计算工具来研究分子吸附。然而，对于非专业用户而言，这些工具有时过于复杂。在本工作中，我们提出 Xsorb，一个基于 Python 的代码，可自动生成吸附构型，引导用户识别最相关的构型，并对其进行完全优化。该代码依赖于成熟的 Python 库，以及一个用于密度泛函理论计算的开源软件包。我们以一个碳氢化合物分子（1-己烯）吸附在铁 (110) 表面上的示例展示了该程序的功能。所提出的计算工具将帮助用户（即使是非专家）轻松识别复杂分子在基底上的最稳定吸附构型，并获得精确的吸附几何结构与能量。
引用
@article{arxiv.2304.14353,
title = {Xsorb: a software for identifying the most stable adsorption configuration and energy of a molecule on a crystal surface},
author = {Enrico Pedretti and Paolo Restuccia and M. Clelia Righi},
journal= {arXiv preprint arXiv:2304.14353},
year = {2023}
}