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XMOL:可解释的多属性分子优化

机器学习 2024-09-13 v1

摘要

分子优化是药物发现和材料科学领域的关键挑战,涉及设计具有所需属性的分子。现有方法主要关注单属性优化,为实现多属性优化需要重复运行,既低效又昂贵。此外,这些方法常缺乏透明度,使研究人员难以理解和控制优化过程。为此,本文提出一种新框架——可解释的多属性分子优化(XMOL),以同时优化多个分子属性并融入可解释性。我们的做法基于最先进的几何扩散模型,通过引入谱归一化和增强的分子约束来实现训练稳定。此外,我们整合了解释性和可解释技术贯穿整个优化过程。我们在真实世界的分子数据集(即QM9)上对XMOL进行评估,结果在单属性和多属性优化方面均表现出色,同时提供可解释的结果,为更高效和可靠的分子设计铺平了道路。

关键词

引用

@article{arxiv.2409.07786,
  title  = {XMOL: Explainable Multi-property Optimization of Molecules},
  author = {Aye Phyu Phyu Aung and Jay Chaudhary and Ji Wei Yoon and Senthilnath Jayavelu},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2409.07786},
  year   = {2024}
}