所见非所得：采样如何影响生物网络的宏观特征
定量方法
2011-06-02 v1 无序系统与神经网络
摘要
我们使用定制随机图理论的数学方法，系统地研究采样对大型生物信号网络拓扑特征的影响。我们的目标是增进对真实生物网络与公共数据存储库中报告并被生物医学科学家使用的不完美且常有偏倚的网络样本之间关系的定量理解。我们针对一大类采样协议（包括（无）偏倚的节点和/或链接欠采样以及（无）偏倚的链接过采样），推导出了采样网络的度分布和度相关核的精确显式公式，这些公式用底层真实网络的度分布和度相关核表示。我们的预测与数值模拟结果高度吻合。
引用
@article{arxiv.1106.0236,
title = {What you see is not what you get: how sampling affects macroscopic features of biological networks},
author = {A. Annibale and A. C. C. Coolen},
journal= {arXiv preprint arXiv:1106.0236},
year = {2011}
}
备注
26 pages, 8 figures