DNA 波:扩展纳米受限聚合物中的传播激发
软凝聚态物质
2016-10-26 v2 统计力学
生物物理
摘要
我们利用纳米流体系统研究沿单条聚合物链出现的热驱动集体现象。在我们的方法中,单个 DNA 分子被限制在刻有嵌入式纳米腔阵列的纳米流体狭缝中;腔晶格的设计使得单条链占据多个腔。荧光视频显微镜数据显示,过量的荧光波跨越跨越腔的分子传播,对应于腔中轮廓过密度的传播涨落。通过检查相邻腔之间强度涨落的相关性来量化这些波。相关性从反相关最小值增长到相关最大值然后衰减,对应于在固定转移时间尺度下相邻腔之间的轮廓转移。观察到的动力学可以使用 Langevin 动力学模拟和耦合扩散的最小晶格模型进行建模。这项研究表明,通过将物理系统重正化为一系列离散腔态,基于受限的聚合物平衡构型塑造可以导致新型动态集体现象。
引用
@article{arxiv.1607.08431,
title = {Waves of DNA: Propagating Excitations in Extended Nanoconfined Polymers},
author = {Alexander R. Klotz and Hendrick W. de Haan and Walter W. Reisner},
journal= {arXiv preprint arXiv:1607.08431},
year = {2016}
}
备注
10 pages, 5 figures, 2 supplementary movies Document updated to include URLs to movies