人类蛋白质组中内在无序的变体
生物大分子
2016-11-21 v1
摘要
在本文中，我们提出了一种直接可操作的无序蛋白变体定义，以人类蛋白质组为案例研究。重点是区分大部分未折叠的蛋白质与包含位于整体折叠结构中的长未折叠区域的蛋白质。具体而言，我们区分如下：i) 无无序蛋白，其所有残基均有序，或者没有长于 30 个残基的无序片段，且无序残基不超过 30%；ii) 具有内在无序区的蛋白，其至少有一个长于 30 个残基的无序结构域，但无序残基少于 30%；iii) 内在无序蛋白，其至少有一个长于 30 个残基的无序片段，且无序残基超过 30%；iv) 具有片段化无序的蛋白，其没有长于 30 个残基的无序片段，但仍有至少 30% 的残基被预测为无序。在几组疾病相关蛋白中检验了这些变体的潜在用途。我们的主要结论指出，IDRPs 比 IDPs 更类似于 NDPs。IDRPs 和 NDPs 具有相似的功能库，并且可能与底物共享锁钥机制。IDRPs 和 IDPs 在人类疾病相关蛋白中的分布不同。IDRPs 可能在复杂疾病的发展中不起特定作用，因为它们在疾病相关蛋白和整个人类蛋白质组中的频率相似。IDPs 可能在癌症、神经退行性疾病、甲状腺和肝脏疾病的出现中发挥作用。
引用
@article{arxiv.1611.06072,
title = {Variants of intrinsic disorder in the human proteome},
author = {Antonio Deiana and Andrea Giansanti},
journal= {arXiv preprint arXiv:1611.06072},
year = {2016}
}