定量质谱中方差函数的估计及其在 iTRAQ 标记中的应用
应用统计
2013-04-17 v1
摘要
本文描述并比较了两种用于估计定量质谱蛋白质组学中 iTRAQ（同重元素标签相对和绝对定量）同位素标记相关方差函数的方法。质谱仪产生的测量值与生物样品中存在的肽段浓度成正比。然而，iTRAQ 报告信号受取决于肽段量的误差影响。因此，误差的方差函数是评估结果的关键参数，但其估计十分复杂，因为干扰参数的数量随样本量增加而增加，而每个肽段的重复次数仍然很少。分析了两项专门旨在估计方差函数及其随时间稳定性的实验，并将所得估计方差函数用于分析针对携带不同致癌突变的细胞中异常信号级联的实验。讨论了构建保守 -值和置信区间的方法。
引用
@article{arxiv.1304.4433,
title = {Variance function estimation in quantitative mass spectrometry with application to iTRAQ labeling},
author = {Micha Mandel and Manor Askenazi and Yi Zhang and Jarrod A. Marto},
journal= {arXiv preprint arXiv:1304.4433},
year = {2013}
}
备注
Published in at http://dx.doi.org/10.1214/12-AOAS572 the Annals of Applied Statistics (http://www.imstat.org/aoas/) by the Institute of Mathematical Statistics (http://www.imstat.org)