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验证 GAN-BioBERT:一种评估临床试验报告趋势的方法论

计算与语言 2021-06-02 v1 机器学习 机器学习

摘要

在过去十年中,关于临床研究中有偏报告问题的讨论颇多。尽管受到关注,用于系统评估临床研究中定性陈述的工具仍十分有限,多数评估定性陈述的研究依赖人工专家评分,这限制了其规模。此外,先前开发大规模工具的尝试(例如使用自然语言处理者)受限于其准确性及用于分类结果的类别数量。鉴于这些局限,本研究旨在开发一种既具有适当准确性又粒度精细的分类算法,以大规模应用于评估临床试验摘要中所表达的定性情感。此外,本研究试图将所提算法 GAN-BioBERT 与先前研究以及专家对临床试验摘要的人工评分进行比较。本研究利用基于 Transformer 双向编码器表示(BERT)模型的半监督自然语言处理模型,从一组学术医学专家标注的临床试验摘要系列中,开发了针对临床试验摘要的三类情感分类算法。结果:该算法的分类准确率为 91.3%,宏 F1 得分为 0.92,与先前方法及专家评分相比准确性显著提升,同时其情感分类比先前研究更细粒度。所提算法 GAN-BioBERT 是适用于临床试验文献中定性陈述大规模评估的分类模型,为临床研究发表趋势的大规模研究提供了准确、可复现的工具。

关键词

引用

@article{arxiv.2106.00665,
  title  = {Validating GAN-BioBERT: A Methodology For Assessing Reporting Trends In Clinical Trials},
  author = {Joshua J Myszewski and Emily Klossowski and Patrick Meyer and Kristin Bevil and Lisa Klesius and Kristopher M Schroeder},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2106.00665},
  year   = {2021}
}

备注

6 pages, 2 figures