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利用 CycleGAN 有效降低 OCT 设备间图像差异并改进视网膜积液分割

计算机视觉与模式识别 2019-01-28 v2

摘要

光学相干断层扫描(OCT)已成为眼科学中最重要的成像方式。近期大量研究致力于开发机器学习(ML)模型,以识别和量化 OCT 图像中的病理特征。在 ML 模型必须应对的若干变异性来源中,主要因素之一是采集设备,这可能限制 ML 模型的泛化能力。在本文中,我们提出使用 CycleGAN(一种无监督非配对图像变换算法)来降低不同 OCT 设备(Spectralis 与 Cirrus)间的图像变异性。该方法的实用性在视网膜积液分割任务中得到评估,即视网膜内囊样积液(IRC)和视网膜下积液(SRF)。首先,我们在源 OCT 设备采集的图像上训练分割模型。随后我们在(1)源图像、(2)目标图像以及(3)目标 OCT 图像的变换版本上评估该模型。所提出的变换策略在 IRC(SRF)分割上分别取得了 0.4(0.51)的 F1 分数。相较于传统变换方法,这意味着 F1 分数提升了 0.2(0.12)。

关键词

引用

@article{arxiv.1901.08379,
  title  = {Using CycleGANs for effectively reducing image variability across OCT devices and improving retinal fluid segmentation},
  author = {Philipp Seeböck and David Romo-Bucheli and Sebastian Waldstein and Hrvoje Bogunović and José Ignacio Orlando and Bianca S. Gerendas and Georg Langs and Ursula Schmidt-Erfurth},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1901.08379},
  year   = {2019}
}

备注

* Contributed equally (order was defined by flipping a coin) --------------- Accepted for publication in the "IEEE International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI) 2019"